Ontomin Ontomin, biyoaktivite, toksisite ve yan etki tahmini için otomatik moleküler madencilik için kullanılan bir veri madenciliği yazılımıdır. Ontomin, 100.0 civarında deneysel olarak belirlenmiş özelliklere dayanır.
Şimdi İndirin

Ontomin Sıralama ve Özet

Ontomin Etiketler

moleküler moleküler evrim moleküler grafikler veri madenciliği madencilik madencilik motoru Moleküler yapıları görselleştirin moleküler modelleme Moleküler geometri moleküler hesap makinesi Süreç madenciliği moleküler yapı Metin madenciliği moleküler izleyici Moleküler görünüm Moleküler tanımlayıcı Moleküler makine Moleküler Dinamik Paketi Moleküler Etkileşim Ağları moleküler model moleküler görselleştirme moleküler editör moleküler modeller moleküler eskiz Moleküler orbital moleküler analiz moleküler tasarım Moleküler tasarımcı İnteraktif Sıra Madenciliği Moleküler madencilik Biyo-Aktivite Testi madencilik aracı Metin madenciliği platformu Metin Madencilik Algoritması moleküler dinamikleri simüle et moleküler çap Moleküler simülasyon moleküler grafik Moleküler Sistem Moleküler altyapı bulun Moleküler gösterim Moleküler dinamikler Moleküler simülatör Moleküler yörüngeyi canlandırın moleküler yüzey Moleküler Topoloji moleküler filogeny nötr moleküler moleküler sekans moleküler filogenetik dizi madenciliği CDK moleküler tanımlayıcısı Moleküler 3-D Görüntüleyici

Ontomin Açıklama

Biyoaktivite için otomatik moleküler madencilik için kullanılan bir veri madenciliği yazılımı Ontomin, biyoaktivite, toksisite ve yan etki tahmini için otomatik moleküler madencilik için kullanılan bir veri madenciliği yazılımıdır. Ontomin, veritabanlarından, ansiklopedilerden ve diğer literatürden toplanan yaklaşık 100.000 farklı küçük moleküllerden deneysel olarak belirlenmiş özelliklere dayanmaktadır. Bu veri seti, binlerce biyoaktivite, uyuşturucu hedefleri, terapötik alanlar, olumsuz etkiler ve toksisitelerden oluşan birkaç bioaktivite sınıfından oluşan hiyerarşik ağaçlara formüle edilmiştir. Her sınıf, yan zincirlerin / kimyasal aktiviteler, halka yapıları vb. Gibi, moleküler özellikleri için ilgili moleküller için bir parmak izi ile temsil edilir. Ontomin ve diğer mevcut yöntemlerle karşılaştırılması Şu anda kullanılmış diğer biyoaktivite tahmin yaklaşımları üç kategoriye ayrılabilir: * Grafik teorik ve altyapı, topolojik ve fizikokimyasal kimyasal tanımlayıcılar * Maksimum ortak altyapılar, parmak izi benzerlikler ve makine öğrenme yöntemleri * Atom Komşuluk Yöntemleri Bununla birlikte, bu yöntemler şu anda mesafe ölçümleri bağımlılığı gibi faktörlerle sınırlıdır, aktivite temsilcisi olmamak, QSAR modellerini birkaç farklı seviyede inşa etmek zor, örn. İlaç hedefleri, biyo işlemler ve terapötik alanın yanı sıra sonuçların yorumlanması. Ontomin (ABD Patentli) bu yöntemlere alternatiftir, yapısal bilgilerin kimyasal olarak, biyolojik olarak veya farmakolojik olarak ilgili moleküllerin hiyerarşik bir kavram ve tanımlayıcıların hiyerarşik bir şemasına dönüştürülmesidir. Ontomin, ilgili şemadaki kalıpları keşfeder ve kalıpları analiz etmekten çıkarılan kuralları kullanarak biyolojik aktiviteyi öngörür. Ontomin algoritmalarının önemli bir avantajı, iskelenin atlamasını etkinleştirmeleridir, çünkü çekirdek iskele bir aktivitenin karakteristik kalıpları keşfedildiğinde korunmadığından. Ontomin desenleri, bir iskeleden bağımsız olarak biyoaktivite için "gerekli ama yeterli olmayan" koşulları temsil eder. Açık iskele atlaması, anayasal izomer üreterek ve kural tabanını kullanarak ilginç molekülleri seçerek yapılabilir. Ontomin sonuçları, faaliyetin basit anlaşılabilir kalıpları olarak sunulmuştur. Ayrıca, ontomin tahminleri milyonlarca molekül için ölçeklenebilirdir. Ek olarak, küratörlük ontomin veri kümeleri, kurum içi bileşik koleksiyonlarının ölçülen molekül aktivitelerinin iç veri kümeleri ile eklenebilir.

Ontomin İlgili Yazılım