Rate4site korunmuş amino-asit sitelerini tespit etmek için bir program
Şimdi İndirin

Rate4site Sıralama ve Özet

Rate4site Etiketler

tespit etmek dedektör asit Asit titrasyonu asit yazı tipi Dosya Hider tespit etmek Asit işlemi Nükleik Asit Analizi Çoklu Sıra Hizalama amino asit bulmak amino asit bulucu amino asit ara Amino asit analizörü amino asit dizisi amino asit amino asit tercümanı asit teması amino asit özü asit çözeltisi amino asit kalıntısı optimal amino asit Nükleik asit dizisi amino asidi analiz etmek nükleik asit amino asit çiftini analiz et Amino Asitler Çifti Analizi amino asit dizisi analizi amino asit dizisini analiz eder amino asit sınıflandırması Amino Asit Topolojisi amino-asit dedektörü amino asidi saptamak korunan mirna bulmak Conserved Mirna Finder Arama korunmuş Mirna amino asit zincirini analiz et asit döngüleri Asit işlemleri asit profesyonel asit pro 7 jar dosyası mobil sc4lot simcity 4 Yazılım timsah mimarı frutloop PC SD2F dönüştürme pst görüntüleyici açık Pinacle Videospin 1.1 Nokia N70 Softweate nero dolby r primo pdf yazarı ATI VGA X300E ücretsiz bubblet

Rate4site Açıklama

Puan4Site, her bir site için nispi evrimsel hızı (MSA) içindeki göreceli evrimsel hızı hesaplayarak tespit etmek için bir program olarak geliştirilmiştir. Genel Bakış: Evrim oranı amino asit bölgeleri arasında sabit değildir: Bazı pozisyonlar yavaşça gelişir ve genellikle "korunmuş" olarak adlandırılırken, diğerleri hızla gelişir ve "değişken" olarak adlandırılır. Hız varyasyonları, bu sitelere etki eden farklı arıtma seçim seviyelerine karşılık gelir. Arındırıcı seçimi, proteininin 3B yapısına katlanması üzerine geometrik kısıtlamaların sonucu, enzimatik aktivitede veya ligand bağlanmasında veya alternatif olarak, protein-protein etkileşimlerinde yer alan amino asit bölgelerinde, amino asit bölgelerinde kısıtlamalarının sonucu olabilir. . Puan4site, olasılıklı bir evrimsel model kullanılarak her bir sitedeki göreceli evrimsel hızı hesaplar. Bu, protein aileleri ve ailendeki proteinlerin filogenetik ağacındaki stokastik işlemin altında yatan stokastik süreç göz önünde bulundurulmasını sağlar. Bir sitedeki koruma skoru sitenin evrimsel oranına karşılık gelir. Metodoloji: PRAT4Site için tek zorunlu giriş bir MSA dosyasıdır. Program daha sonra mevcut MSA ile tutarlı olan bir filogenetik ağacı hesaplar (kullanıcı önceden hesaplanmış bir ağaç girebilir). Daha sonra MSA'daki her site için nispi koruma skorunu hesaplar. Bu, ampirik bir Bayesian yöntemi veya maksimum bir olasılık yöntemi kullanılarak gerçekleştirilir (Pupko ve ark. 2002).

Rate4site İlgili Yazılım