WPDB veritabanı yükleyici

Biyolojik makromoleküllerin 3B yapısını hızlı ve kolay analiz edin.
Şimdi İndirin

WPDB veritabanı yükleyici Sıralama ve Özet

Reklamcılık

  • Rating:
  • Lisans:
  • Freeware
  • Yayıncı adı:
  • Ilya Shindyalov & Phil Bourne
  • İşletim sistemleri:
  • Windows All
  • Dosya boyutu:
  • 255 KB

WPDB veritabanı yükleyici Etiketler


WPDB veritabanı yükleyici Açıklama

WPDB veritabanı yükleyici kullanışlı, biyolojik makromoleküllerin 3 boyutlu yapısını, protein veri bankasında (PDB), yukarıda gösterilenler gibi sorgu ve görüntüleme araçlarında bulduğu için 3 boyutlu yapısını sorgulamanıza yardımcı olmak için özel olarak tasarlanmış kullanımı kolaydır. Ana Özellikler: Bilimsel: Metin ve sekans aramalarına dayalı yapıları bulun (izinsiz uyumsuzluklar). İğneman ve Wunsch yöntemine göre birden fazla hedef diziye karşı bir kayıt dizisinin sıralaması (JMB 48 (3): 443-453, 1970). Hendrickson yöntemine göre CALPHA pozisyonlarını kullanarak yapı süperpozisyonu (ACTA Crysta35: 158-163, 1979. İkincil yapı atamaları Kabsch ve Sander yöntemine göre. Amino Asit özellik profili analizi, hem statik hem de dinamik: Bogardt ve arkadaşları tarafından derlenen değerlere göre statik; LEE ve Richards'a (JMB 55: 379-400, 1971) göre dinamik, ortalama maruz kalma ve deneysel B faktörü için tek bir polipeptit zinciri veya iki hizalı polipeptit zinciri için fark profilleri incelenebilir. Farklı kesme mesafelerinde ve kontaklama yapılarında veya üst üste gelen yapılardaki farklı atom gruplarıyla harita analiziyle iletişime geçin (fark temas haritaları) incelenebilir. Altyapılar, CPK gösterimi, stereo ve basit yüzeyleri (kullanıcıya göre renkli tabanlı renkli) görüntülemek veya vurgulamak için seçenekler dahil, tipik 3 boyutlu görüntüleme ve işleme. GEOETETRY HESABI (BOND uzunlukları, bağ açıları, dihedral açıları, yakın bağlanmamış temaslar), grafiksel gösterim ve küçük molekül mesafelerinden sapmalar dahil. Bilgi İşlem: veri sıkıştırması - PDB ASCII dosya dağılımı üzerinde depoda 20 kat azaltma, ancak: (i) Bibliyografik bilgiler yazar ve JRNL kayıtları ile sınırlıdır; (ii) isteğe bağlı olarak bir NMR veya model yapıları topluluğunun birinci veya tüm üyeleri; (iii) Kısmi meslektaşları olan bir kristal yapının parçaları için PDB dosyasında tanımlanan ilk alternatif konformasyon; (iv) Atomik koordinatlar 2 ve 3 ondalık basamağa yuvarlanır; (v) PDB Not Recks. Birlikte Çalışabilir Ekran Nesneleri - Bir özellik bir ekran nesnesinde (e.ga iletişim haritası), diğer tüm görünür gösterim nesneleri (E.G3-D görüntüleyici) ve daha sonra çağrılan olanları, bu özelliği göstermek için de güncelleştirilir. . Popüler moleküler ekran programına Raswin'e doğrudan erişim. DoctOhelp paketi kullanılarak oluşturulan basılı belgeler ve bağlam duyarlı yardımı senkronize edildi.


WPDB veritabanı yükleyici İlgili Yazılım

Sencalc

Parantez ve işlem önceliği olan bir tamsayı aritmetik hesap makinesi. ...

181 18 KB

İndirmek