jmodeltest Filogenetik Model Ortalama
Şimdi İndirin

jmodeltest Sıralama ve Özet

jmodeltest Etiketler

Filogenetik Sistematik ikame nükleotit Filogenetik analiz filogenetik analizör filogenetik ayak izi filogenetik bağlam filogenetik Filogenetik probu kontrol edin Filogenetik Prob Denetleyicisi test filogenetik probu Filogenetik Ağı Hesaplama nükleotid ikamesi Filogenetik Model Ortalama Filogenetik model Filogenetik Ağı Mağaza Filogenetik verileri analiz edin filogenetik veriler filogenetik görev cimriliği Filogenetik Analizler Filogenetik Süper Tezgahları Filogenetik Süper Tezgahları Oluşturun test filogenetik bağımsızlığı Tipik filogenetik analiz filogenetik hipotez Filogenetik İlişki Filogenetik Yeniden Yapılanma Filogenetik Topoloji Filogenetik jeneratör Zirve ortalaması

jmodeltest Açıklama

JMODELTEST, büyük veri paketleri için destekle, DNA analizinde yararlı olan bir seçimden oluşan bir nükleotit ikamesi seçebilecek bilimsel bir uygulamadır. DNA alanındaki araştırmacıların yanı sıra öğrencileri, öğretmenleri hedefleyen açık kaynaklı, çapraz platform projesidir. Bununla birlikte, analizlerin çoğu otomatik olarak yapılır, ancak çoğunlukla sonuçların yorumlanması için, kullanıcıdan ileri nükleotit bilgisi bekleniyor. JMODELTEST, başarıyla çalıştırmak için Java Runtime ortamına dayanır, ancak sağlama ihtiyacınız olan tek bağımlılık budur. Taşınabilir bir paketin içine sarılır, bu nedenle kurulum gerekli değildir. Jmodeltest'in arayüzü oldukça basittir, ancak içine gömülü fonksiyonlar daha karmaşık bir doğadır. GUI'nin çoğu, veri analizine ve bu işlemden kaynaklanan raporların analizine, bu işlemden kaynaklanan raporlar, kaynak dosyanın içindeki bilgilere bağlı olarak oldukça uzun olabilir. Beş farklı seçim stratejisi vardır ve bunlar, aşağıdaki gibi analiz menüsünün içine gömülüdür: AIC (AKAike bilgi kriteri), BIC (Bayesian bilgi kriteri), DT (Karar Teorisi), HLRT (hiyerarşik olasılık oranı testleri) ve filojenik ortalama. Bunların hepsi gerçek analiz işleminden önce yapılandırılabilir; Örneğin, güven aralığını ayarlayabilir veya bir model ortalamayı gerçekleştirmek için uygulamayı ayarlayabilirsiniz. Kapalı olmak için, programın özelleştirilebilir fiyat varyasyonuna ve önceden seçilmiş bir temel ağaç modeline bağlı bir olasılık puanı hesaplaması yapmasını da söyleyebilirsiniz. Sonuç olarak, JMODELTEST zaman kazandırabilir ve bilim adamları, geleneksel yollarla DNA analiz işlemlerini gerçekleştirmeye yatırım yapacaklardır. Ancak, sonuçların tam olarak doğrulanması önerilir. Bu yorum 17 Ağustos 2014 tarihinde En Son AndreeA Matei tarafından yapılmıştır.

jmodeltest İlgili Yazılım