GabeditGaussian ve molpro için GUI. | |
Şimdi İndirin |
Gabedit Sıralama ve Özet
Reklamcılık
- Lisans:
- BSD License
- Fiyat:
- FREE
- Yayıncı adı:
- Allouche abdul-Rahman
- yayıncı web sitesi:
- http://lasim.univ-lyon1.fr/allouche/gabedit
Gabedit Etiketler
Gabedit Açıklama
Gauss ve Molpro için GUI. Gabedit, Gaussian, Molcas, Molpro ve MPQC Hesaplamalı Kimya paketlerine grafiksel bir kullanıcı arayüzüdür. Gabedit, anahtar kelimeler ve seçenekleri, molekül spesifikasyonları oluşturmak için grafiksel olanaklar, molekül spesifikasyonları ve en gelişmiş hesaplama türleri bile Gabedit, gelişmiş bir molekül oluşturucu içerir. Moleküller halinde hızlı bir şekilde kroki için kullanabilir ve bunları üç boyutta inceleyebilirsiniz. Atom, halka, grup, amino asit ve nükleosit tarafından moleküller oluşturabilirsiniz. Geometriyi bir dosyadan da okuyabilirsiniz. En büyük moleküler dosya formatları desteklenir. Gabedit, Gaussian, Molcas, Molpro ve MPQC işlerini basit ve basit bir şekilde ayarlamanıza olanak tanıyan Gaussian, Molcas, Molpro ve MPQC hesaplama kurulumu penceresi bulunur. Gabedit, Molcas, Molpro, Gaussian ve MPQC giriş dosyalarını düzenlemek için bir metin editörü içerir. Gabedit, aşağıdakiler de dahil olmak üzere çeşitli Gauss, Molcas, MolPro, MPQC ve (kısmen) ADF hesaplama sonuçlarını grafiksel olarak gösterebilir: · Moleküler orbitaller. · Elektron yoğunluğundan yüzeyler, elektrostatik potansiyel, NMR koruma yoğunluğu ve diğer özellikler. · Yüzeyler, katı, yarı saydam ve tel örgü modlarında görüntülenebilir. · Yüzeyler ayrı bir özellik ile renklendirilebilir. · Konturlar (colorcoded). · Uçaklar (colorcoded). · Dipol · XYZ eksenleri ve molekülün asıl eksenleri. · Titreşim frekanslarına karşılık gelen normal modların animasyonu. · Geometri, yüzey, dipol, XYZ ve molekülün asıl eksenlerinin dönüşünün animasyonu. · Konturların animasyonu. · Renkli uçakların animasyonu. Gabedit, IR ve Raman bilgisayarlı spektrumları görüntüleyebilir. Gabedit, geometri için bir POVRAY dosyası (hidrojen bağları dahil), yüzeyler (renk kokulu yüzeyler dahil), kontürler, renklendirilmiş uçaklar. Gabedit, fotoğrafı PPM, BMP, (JPEG) ve PS formatında kaydedebilir. Gabedit, animasyon için otomatik olarak bir dizi resim üretebilir (titreşim, geometri yakınsama, dönme, kontürler, renklendirilmiş uçaklar) gereksinimleri: · GTK + Bu sürümde yenilikler: · Küçük hatalar düzeltildi · Tüm geometrik değişiklikler geri alınabilir ve geri alınabilir ve yeniden yapılabilir (U / U veya CTRL Z / CTRL Y) · Kullanıcı, çizimde görüntülenen bağlar üzerinde tam kontrol sahibidir. · Molekül atomunun atom tarafından çizilmesi basitleştirilmiştir. · Molekül parçasının fragmanla çizilmesi basitleştirilmiştir. · Gabedit, Gabedit, Hin, PDB, MOL2 ve MOL dosyalarından bağlantılar okuyun. · Kullanıcı, mesafenin, bağ açısının ve dihedral açının değerini ayarlayabilir. · Moleküler bir dinamik konformasyonel arama, bir mm potansiyeli kullanılarak uygulanır (Amber 99). · Bir moleküler dinamik konformasyonel arama, yarı ampirik bir yöntem kullanılarak uygulanır (açık MOPAC veya PCGAMESS'ten). · GDK Çizim işlevlerinden Cairo'ya geçiş: Vektör grafikleri için çapraz cihaz oluşturma. · Kahire şimdi XYPLTOT GABEDIT Widget için kullanılıyor (Gabedit tarafından çizmek spektrumları için kullanılır). · Kahire artık geometri çizim penceresi için kullanılıyor. · Geometri EPS, PS, PDF veya SVG dosyasında dışa aktarılabilir. · Xyplot penceresinin eğrileri EPS, PS, PDF veya SVG dosyasında dışa aktarılabilir. · Xyplot penceresinde 2 puan arasındaki hesaplama mesafesi için yeni bir araç. Xyplot penceresinde bir zoom yapmak için "Control + Shift düğmesi" kullanılabilir. · PCGAMESS'in yeni sürümü (Firefly) şimdi destekleniyor
Gabedit İlgili Yazılım