Oligocheck

Filogenetik probların kalitesini ve astar setlerinin kalitesini kontrol edin
Şimdi İndirin

Oligocheck Sıralama ve Özet

Reklamcılık

  • Rating:
  • Lisans:
  • GPL
  • Yayıncı adı:
  • Kevin Ashelford
  • İşletim sistemleri:
  • Windows All
  • Dosya boyutu:
  • 11.9 MB

Oligocheck Etiketler


Oligocheck Açıklama

Oligocheck, sağlamlığı değerlendirmek için tasarlanan, bir astar setinin veya probun filogenetik aralığını, potansiyel hedef sekansı olan baz uyumsuz sayıları olarak değerlendirerek tasarlanan bir Java tabanlı bir araçtır. Kullanıcı, bir nükleik asit dizisinin bir veritabanıyla birlikte kontrol edilmesi için bir astar seti veya probunu sağlar. Oligocheck, primer setini veya probunu veritabanındaki her bir kayıtla karşı kontrol eder ve eşleşmelerin artan sayıda baz uyumsuzluğa izin verilip verilmeyeceğini belirtir. Elde edilen analiz, sıra kayıt verilerinin yanı sıra grafiksel bir biçimde görüntülenir. Nükleik asit primer setlerinin ve problarının yalnızca doğru nükleik asit sekansına bağlanması kabiliyeti, spesifik filogenetik grupların doğru hedeflenmesi için temeldir. Böyle bir özgüllük, büyük ölçüde, bu oligonükleotitler hedefinin nükleik asit dizisinin bölgesinin benzersizliğine bağlıdır. Bölge ne kadar benzersiz olursa, primer seti veya probu, tavlama sıcaklığında ve diğer biyokimyasal olarak ilgili parametrelerdeki varyasyonlar, bir veya daha fazla baz farklılıkları olan hedeflerle başarılı bir şekilde bağlanan oligonükleotidlerin bağlanmasına neden olsa bile, primer seti veya probu sadece amaçlanan hedefe tavlama yapacak. Böylece, bir veya daha fazla uyuşmazlığa izin verildiğinde bile, sağlam bir astar seti veya probu, yalnızca amaçlanan hedefine tahrif eden biri olarak görülebilir.


Oligocheck İlgili Yazılım

GEDI-ADMX

Karıştırılmış popülasyonlar için genotip hata tespiti ve itici ...

226 7.3 MB

İndirmek