Vplg

Protein grafiklerini hesaplayın ve görselleştirin
Şimdi İndirin

Vplg Sıralama ve Özet

Reklamcılık

  • Rating:
  • Lisans:
  • Freeware
  • Yayıncı adı:
  • Tim Schafer
  • Dosya boyutu:
  • 6.6 MB

Vplg Etiketler


Vplg Açıklama

VPLG veya protein ligand grafiğinin görselleştirilmesi, proteinlerin süper ikincil yapı düzeyinde yapısını tanımlamak için grafik tabanlı bir model kullanan bir araçtır. Bir protein ligand grafiği, bir PDB dosyasındaki atom koordinatlarından ve DSSP algoritmasının ikincil yapı atamalarından hesaplanır. Bu grafikte, köşeler ikincil yapı elemanlarını (SSSS, örneğin, ALPHA HELEKLERİ VE BETA SHEAL) veya LIGAND moleküllerini temsil ederken, aralarındaki kontakları ve mekansal ilişkileri modellerken. VPLG, SVG çıkışı için Apache Batik Kütüphanesi kullanarak Java'da yazılmıştır ve birden fazla platformda çalışabilir. Ana Özellikler: , PDB dosyalarından 3 boyutlu atom verilerini ve DSSP dosyalarından ikincil yapı atamaları okur verilerden bir protein-ligand grafiğini hesaplar ve grafiği görselleştirir Grafik görüntülerin bitmap (.png) ve vektör (.svg) formatlarında çıktısını destekler Düz bir metin dosyasında protein-ligand grafiklerini, bir bilgisayar programı ile düzenlemek, ayrıştırmak ve oluşturmak kolay olan kendi biçiminde (.plg). .plg dosyalarından 'dan protein grafiklerini okuyabilir ve doğrudan görselleştirebilir.


Vplg İlgili Yazılım

Hakkımızda