Varscan Bu uygulamayla SNPS'yi kolayca tanımlayın
Şimdi İndirin

Varscan Sıralama ve Özet

Varscan Etiketler

tanımlamak tanımlayıcı Snp Naruto jar yazılımı 160BY2 SMS Yazılımı MP3 Kesici Yazılımı için Bluetooth yazılımı moto u5 razr winamp dans kızlar utorrent depremi 2 Ubuntu için Netscape craigslist de las büyük torrent SALA Terminal Servisi Nokia E60 Kamera msplayer

Varscan Açıklama

Varscan, bireysel ve havuzlu örneklerin kitlesel paralel sıralamasında, SNP'leri ve indonları belirlemek için bir platform ve teknoloji-bağımsız yardımcı program olarak tasarlanmış bir Java tabanlı bir araçtır. Tek bir numune için veriler verilen VERSCAN, okuma sayımlarına, baz kalitesine ve alel frekansına dayanan germline varyantlarını tanımlar ve filtreler. Bir tümör-normal çifti için verilen veriler, Varscan ayrıca örnekler arasındaki okuma sayıları karşılaştırarak her bir varyantın (germline, somatik veya LOH) somatik durumunu da belirler. Ana Özellikler: SPP'leri ve SamTools Periup dosyalarından ingels'i çağırır Varyantları kapsama, okuma derinliği, varyant frekansı ve baz kalitesi ile filtreler , tümör-normal çiftler için somatik durumu (somatik, germline, LOH) belirler iki varyantın iki listesini karşılaştırır, birleştirir ve kesişir. Varyant çağrıları bir dizi hedef pozisyona veya hedef bölgelere sınırlar

Varscan İlgili Yazılım