 | YoğunlukfitAraştırmanızda size yardımcı olacak aracı |
| Şimdi İndirin | |
Yoğunlukfit Sıralama ve Özet
Reklamcılık
Yoğunlukfit Etiketler
Yoğunlukfit Açıklama
Elektron mikroskobu yapısal biyolojide önemli bir araç haline geldi. X-ışını kristalografisine uygun bir 3D kristalde kristalize edilemeyecek birçok protein, yine de tek moleküller olarak veya 2D kristaller şeklinde elektron mikroskopisi ile incelenebilir. Bununla birlikte, ortaya çıkan yapıların çok düşük bir çözünürlüğe sahiptir. Nadir istisnalarla, elektron mikroskobu ile elde edilen elektron yoğunluğu haritaları, atomik çözünürlükteki yapıyı tanımlamak için yeterli değildir. Bazı durumlarda, aynı proteinin atomik düzeyinde bir yapısı başka bir konformasyonda mevcuttur. YoğunlukFit, bu bilgileri düşük çözünürlüklü yapıya göre birleştirmek için tasarlanmış bir araçtır. Bu piton bazlı alet, bilinen atomik yapıyı deforme ederek, düşük çözünürlüklü elektron yoğunluğu haritasına uymasını sağlar. Proteinin esnekliği, düşük enerjili normal modlar izin verilen deformasyonları tanımlayan elastik bir ağ modeli tarafından tanımlanır. Bu prosedür, proteinin bütünlüğünün deformasyon sırasında korunmadığını garanti eder. Yayınlanan diğer benzer algoritmalarla karşılaştırıldığında, yoğunlukfitte uygulanan kişi, orta boy bir protein, CA-atpaz için gerçek deneysel verilerde test edilme avantajına sahiptir. Algoritma ve CA-ATPASE'e başvurusu açıklanmıştır.
Yoğunlukfit İlgili Yazılım
